生態研究旨在收集大嶼山具生態價值、位處郊野公園外地區的生態資料用作評估這些地區的生態重要性、辨識其生態威脅，並探討各種保育方案的可行性。生態研究會按優次分三批進行。
- 第一批研究：「貝澳、水口、大澳及其鄰近地區的生態研究 – 可行性研究」
- 第二批研究：「䃟頭至深屈、二澳及十塱生態調查研究 – 可行性研究」
- 第三批研究：「大嶼山十二處地點的生態研究 – 可行性研究」
項目範圍
- 檢視研究範圍內的現有生態資料及進行生態調查，以評估不同地點的生態重要性。
- 辨識及評估研究範圍內現有和潛在的生態威脅，並建議合適的保育措施，以修復及改善生態資源。
目前進度
第一及第二批研究已完成，行政摘要已上載至土木工程拓展署網站供公眾查閱。第三批研究預計於2025年初開展。
